經國務院同意、民政部批準，中國棉花協會于9月28日在京召開了成立大會。國務院副總理回良玉為中國棉花協會成立做了重要批示：“辦好中國棉花協會，對于完善我國棉花社會化服務體系，推動棉花產業化經營，維護公平、有序的市場環境，提高棉花和棉紡織品的競爭力，都具有重要作用。”他希望中國棉花協會“加強政府與棉農、企業之間的信息溝通，充分發揮橋梁和紐帶作用，努力成為行業的代言人，政府的好幫手，為促進我國棉花產業健康發展做出貢獻。”
9月27日，中國棉花協會在北京召開了第一屆會員代表大會，來自全國各地的200余名會員代表討論通過了《中國棉花協會章程》和《中國棉花協會會員公約》，選舉產生了協會領導機構。9月28日，中國棉花協會召開成立大會，全國政協副主席、中華全國供銷合作總社主任白立忱、中國紡織工業協會會長杜鈺洲以及民政部民間組織管理局、農業部種植業管理司等有關領導到會致辭。
據中國棉花協會會長周聲濤（中華全國供銷合作總社黨組書記、常務副主任）介紹，我國是世界上最大的棉花生產國與消費國，棉花在國民經濟中的地位舉足輕重，為了協調好棉花生產、流通、消費各個環節的利益關系，促進棉花產業健康、持續發展，保障入世以后國內棉業的總體利益，成立中國棉花行業協會勢在必行。
中國棉花協會是由棉農及棉農合作組織，棉花生產、收購、加工、經營、倉儲企業，棉紡織企業和棉花研究機構等涉棉企業和組織自愿組成的、具備全國性社會團體法人資格的非營利性行業組織，接受全國供銷合作總社與民政部的業務指導和監督管理。
中國棉花協會的根本宗旨是服務、自律、協調、維權。
協會不是會員的“管家”，而是“服務員”，一切工作的開展都要從會員的切身利益、行業的總體利益出發，為會員提供信息、咨詢、培訓、聯絡、理論等方面的服務，時刻傾聽會員的意見和建議，為行業爭取一個寬松、有序、規范的生產經營環境和發展條件。同時加強調查研究，掌握行業信息，給政府部門當好參謀，為國家宏觀決策提供依據。 業內的真正自律，是市場能否規范發展的重要條件。協會將根據全行業整體利益，制訂會員認可的會員公約，建立“黑名單”預警制度，形成業內自我約束、規范發展的機制，努力建立起棉花行業的信用體系，協助政府部門營造健康有序的市場環境。
協會將致力協調好會員之間、行業內各個利益主體之間的關系，以保證生產、流通、消費三方面利益的最優化。
作為行業的代言人，中國棉花協會以維護會員和行業的權益為己任，積極爭取政策，創造有利于棉花產業發展的宏觀環境。同時，在遵守世貿組織基本原則的前提下，保障和維護國內棉業在國際、國內市場的應有地位。
